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1997年12月8日，36位港区全国人大代表经选举顺利产生，他们在1998年3月首次独立组团出席全国人民代表大会，参与国是，参政议政。
1999年 1月30日 全国人大常委会通过关于香港特区九届全国人大代表辞去代表职务的办法的决定。
2001年3月5日，国家主席江泽民、全国人大常委会委员长李鹏、全国政协主席李瑞环在人民大会堂会见出席九届全国人大四次会议的港澳特区全国人大代表。
2002年3月8日，国务院总理朱镕基看望港澳界全国政协委员，听取意见。朱镕基指出，香港特别行政区和澳门特别行政区成立以来，“一国两制”、“港人治港”、“澳人治澳”、高度自治的方针得到贯彻落实，向世人展示了“一国两制”实践的成功。目前港澳的形势总体是好的，中央政府对两个特别行政区的工作是满意的。港澳政协委员为港澳的社会稳定和经济发展做了很大贡献，希望继续支持行政长官和特别行政区政府的工作，维护港澳的长期繁荣稳定。
2003年6月30日，国务院总理温家宝在香港会见部分香港特区全国人大代表、全国政协委员。
2011年4月23日，温家宝邀请曾连续当选第四届至第十届全国人大代表的吴康民到中南海做客。
2005年3月12日，全国政协十届三次会议增选董建华为全国政协副主席。
2008年3月，董建华当选第十一届全国政协副主席。2013年3月，中国人民政治协商会议第十二届全国委员会第一次会议举行全体会议，董建华再次当选政协副主席。
2006年10月28日，全国政协副主席霍英东在北京逝世。受中央委托，全国政协副主席王忠禹，全国政协副主席、国务院港澳事务办公室主任廖晖，全国政协副主席、中共中央统战部部长刘延东，全国政协副主席董建华参加悼念仪式。全国政协副主席、治丧委员会主任王忠禹致悼词。
2006年11月7日，在香港殡仪馆举行霍英东悼念和公祭仪式，霍英东的灵柩覆盖着中华人民共和国国旗。
2006年2月，梁爱诗出任全国人大常委会香港特别行政区基本法委员会副主任。
2008年9月30日，范徐丽泰正式卸任香港立法会主席，就任港区全国人大常务委员会委员。
2008年3月6日，国家主席胡锦涛在北京人民大会堂会见出席十一届全国人大一次会议和全国政协十一届一次会议的香港、澳门地区全国人大代表、全国政协委员。胡锦涛要求香港特别行政区、澳门特别行政区的全国人大代表、全国政协委员既要积极参与国是，更要积极为“一国两制”在香港、澳门的成功实践贡献力量。香港、澳门回归以来的事实充分证明，“一国两制”、“港人治港”、“澳人治澳”、高度自治的方针是完全正确的，香港同胞、澳门同胞完全有智慧、有能力管理好、建设好香港、澳门，伟大祖国永远是香港、澳门繁荣稳定的坚强后盾。
2011年6月22日，中共中央政治局常委、国家副主席习近平在北京人民大会堂亲切会见港区省级政协委员联谊会访问团全体成员。习近平对港区省级政协委员联谊会访问团表示欢迎。他说，港区省级政协委员联谊会成立以来，高举爱国爱港旗帜、团结香港各界人士、有力支持了行政长官和特别行政区政府依法施政；积极组织港区省级政协委员参政议政、投身内地改革开放和现代化建设、促进了香港与内地交流合作；同时，也为加强与台湾岛内联系、反对“台独”分裂势力、推动祖国和平统一进程作出了自己的贡献。
2012年3月4日，中共中央政治局常委、国家副主席习近平看望港澳地区全国政协委员，并参加讨论。习近平希望港澳地区全国政协委员围绕国家大局和港澳长期繁荣稳定，更加积极主动地为国家发展建言献策，更加积极主动地参与港澳社会政治事务，更加团结地维护港澳社会和谐稳定，积极推动社会各方面顾全大局、理性沟通，进一步促进包容共济、和谐稳定。
2012年12月9日，香港特别行政区第十二届全国人大代表选举会议主席团在香港举行第二次会议。主席团经过审查，确认送交登记表的52人符合代表候选人条件，为香港特别行政区第十二届全国人大代表候选人。主席团常务主席梁振英主持会议。
2012年12月19日，香港特别行政区第十二届全国人大代表选举会议第二次全体会议,选举产生了36名香港特别行政区第十二届全国人大代表。受全国人大常委会委托前来香港主持选举工作的全国人大常委会副委员长兼秘书长李建国出席会议
2013年6月29日，全国人大常委会委员长张德江在人民大会堂向全国人大常委会第四届香港特别行政区基本法委员会12名组成人员颁发任命书。
2014年5月22日，中共中央政治局常委、全国政协主席俞正声在北京会见香港特区省级政协委员联谊会访京团。俞正声表示，港区政协委员要自觉担当责任，做香港和内地交流交往的纽带，为增进两地交流和理解献计出力；联谊会要密切保持与内地政协组织之间的联系，支持政协的各项工作，多提意见建议，为国家经济社会发展、为人民政协事业的发展多作贡献。
2014年5月23日，国务委员杨洁篪在清华大学出席了“香港特区政府高级公务员国家事务课程20周年纪念大会”。杨洁篪在讲话中对过去20年港澳公务员国情培训工作所取得的成就予以充分肯定，并希望在今后的培训中进一步增加对“一国两制”方针和基本法及国家发展方略的学习，以提高港澳公务员全面、准确地理解和贯彻“一国两制”方针和基本法的能力，让港澳公务员更加全面、深入了解国家整体形势，把握未来发展的大势，为“一国两制”的成功实践作出积极贡献。
2014年8月21日，全国人大常委会办公厅在深圳召开“香港特别行政区政制发展座谈会”，就十二届全国人大常委会第十次会议即将审议的《关于香港特别行政区2017年行政长官及2016年立法会产生办法是否需要修改的报告》听取了香港特区人大代表和政协委员等方面人士的意见。
2015年9月10日，由全国政协副主席董建华、李海峰率领的香港特区全国政协委员考察团抵达黑龙江省，就“中蒙俄经济走廊”黑龙江陆海丝绸之路经济带（简称“龙江丝路带”）专题开始为期四天的考察。
2016年10月9日至17日，香港特别行政区第十二届全国人大代表赴四川成都、德阳、雅安、凉山等地开展为期9天的视察。代表、委员们通过视察等方式，认真履职，积极建言献策。
2016年3月3日，全国政协主席俞正声在全国政协十二届四次会议报告中表示，要鼓励港澳地区政协委员发挥双重作用。俞正声指出，全面准确贯彻“一国两制”、“港人治港”、“澳人治澳”、高度自治方针，严格依照宪法和基本法办事，支持特别行政区行政长官和政府依法施政，鼓励港澳地区政协委员发挥双重积极作用，为促进内地与港澳合作发展献计出力，广泛深入地参与港澳青少年工作。
2017年3月6日，中共中央政治局常委、全国人大常委会委员长张德江参加十二届全国人大五次会议香港代表团审议。张德江指出，党的十八大以来，在以习近平同志为核心的党中央坚强领导下，国家各项事业都取得了可喜成绩，“一国两制”实践取得新进展。今年是香港回归祖国20周年，香港社会要进一步全面准确贯彻“一国两制”方针和基本法，保持香港社会政治稳定、经济繁荣。希望香港依法顺利选出符合中央要求的新一任行政长官人选。
2017年4月7日，香港中华总商会及香港友好协进会共同举办解读“两会”论坛。邀请部分在港全国人大代表和政协委员围绕今年“两会”内容与成果、中国经济未来发展、一带一路建设新举措，以及香港的机遇和发展等议题展开充分有效的研讨。
